Actualmente, el programa de Maestría en Economía Aplicada mantiene vínculos con algunas universidades en el extranjero que cuentan con programa de posgrado, por lo que es posible el intercambio de estudiantes y docentes, lo cual representa un beneficio para los estudiantes del programa. Algunas de estas universidades son:
• Booth Business School (Universidad de Chicago)
• Brandeis University (EE.UU.)
• Helsinki School of Economics (Finlandia)
• Norwegian School of Economics (Noruega)
• NOVA Universidad (Lisboa)
• Stockholm School of Economics (Suecia)
• St. Gallen University (Suiza)
• Universidad Torcuato Di Tella (Argentina)
• Universidad CEMA (Argentina)
• Universidad de Chile (Chile)
• Universitá Luigi Bocconi (Italia)
• Université Catholique de Louvain-la-Neuve (Bélgica)
• Wirtschaftsuniversität Wien (Austria)